秉承“博思精艺，厚朴远志”的创新精神，研究院以中医药理论为指导，围绕中医优势领域，运用前沿和先进技术，开发国际先进、现代临床认同的的创新中药，推动中药标准化、现代化、国际化进程。

经过20余年的持续发展、创新积累，建设了包括江苏连云港、南京、上海等科研中心，拥有系统完善的从创新中药发现—研发—上市后再评价的全流程研发平台。实验面积达30000㎡，仪器设备原值1.6亿元，每年投入的研发经费占销售收入的7%以上，先后与国内科研院所联合建立了10余个“共建实验室”，并设有“中药制药过程新技术国家重点实验室”、“国家重大新药创制企业综合大平台”、“国家博士后科研工作站”、“国家认定企业技术中心”等国家级科研平台。

研究院先后开发中药新药40余个；申请专利300余件，获发明专利授权200余件；作为科技部首批立项申请美国FDA药品注册的复方中药之一，桂枝茯苓胶囊已在美国完成Ⅱ期临床试验；研究成果荣获国家科技进步二等奖2项、省级科技进步奖10余项、市级科技进步奖20余项。

依托企业中药制药过程新技术国家重点实验室，在中药制药过程控制和智能制造关键技术上取得了突破，并于2015年3月建成了我国第一个中药数字化智能制造工厂，实现中药复杂体系生产过程的智能化、信息化、数字化、动态优化生产，为中国药品制造进入数字化、智能化制造时代提供了应用示范。